| jh260013 |
大規模比較ゲノム解析による病原細菌の進化と病態発症機構の解明 |
| 課題代表者 |
山口雅也(国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所
ヘルス・メディカル微生物研究センター)
Masaya Yamaguchi
(Microbial Research Center for Health and Medicine, National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition)
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| 概要 |
肺炎球菌と化膿レンサ球菌の重症化要因に加え、薬剤耐性化と常在細菌叢との関係を調査する。パンゲノムワイド関連解析やマウス感染モデル、シングルセル解析を用いて細菌の病原性や免疫応答を解析し、耐性遺伝子の獲得機構も明らかにする。さらに、口腔および腸内細菌叢のメタゲノム解析を行い、細菌の遺伝的多様性や薬剤耐性遺伝子の分布を調査する。多分野協力と高度な計算資源を活用し、新たな感染症制御の知見を得る。
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| 関連Webページ |
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| 報告書等 |
研究紹介ポスター
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最終報告書
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| 業績一覧 |
(1) 学術論文 （査読あり） |
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Yusei Tataka, Hitoshi Kawashima, Hinako Nanri, Daiki Watanabe, Kenji Watanabe, Masaya Yamaguchi, Jun Kunisawa, Motohiko Miyachi, Standardization of shotgun metagenomics parameters for pks-positive enterobacteria detection in human fecal samples: Receiver operating characteristic analysis using polymerase chain reaction as reference standard, BMC Microbiology
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| (2) 国際会議プロシーディングス （査読あり） |
| 該当なし |
| (3) 国際会議発表（査読なし） |
| 該当なし |
| (4) 国内会議発表（査読なし） |
| 該当なし |
| (5) 公開したライブラリなど |
| 該当なし |
| (6) その他（特許，プレスリリース，著書等） |
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Kotaro Higashi, Katsuki Takebe, Yumi Tsutsumi, Takeshi Sangawa, Masayuki Ono, Masanobu Nakata, Samira Dahesh, Tomoko Sumitomo, Mamoru Suzuki, Victor Nizet, Shigetada Kawabata, M. Yamaguchi, Structural and Phylogenetic Analysis of Streptococcus Pyogenes Hyaluronate Lyase Inactivation and Evolution
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Lin Xu, Yanran Wu, Maiko Omi-Sugihara, Takayuki Tsujimoto, Yujie Dang, Qi Wang, Xiuping Nie, Daisuke Motooka, Haruka Ohara, Toshihiro Inubushi, Masaya Yamaguchi, Lisa L. Sandell, Paul A Trainor, Takashi Yamashiro, Hiroshi Kurosaka, Retinoid signaling promotes frontonasal identity while repressing maxillary identity during craniofacial development
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Takashi Saito, Momoko Kobayashi, Zhengkuan Sun, Satoshi Muraoka, Daisuke Motooka, Takako Yoshida, Shin-ichi Shiomi, Jun Adachi, Masaya Yamaguchi, Real-time near-infrared imaging distinguishes nasopharyngeal colonization from aspiration of
<i>Streptococcus pneumoniae</i>
and identifies aspiration as a trigger of severe disease
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