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採択課題 【詳細】

jh260001 FMOプログラムABINIT-MPの次世代化
課題代表者 望月祐志(立教大学 理学部)
Yuji Mochizuki (Faculuty of Science, Rikkyo University)
概要 本課題では、フラグメント分子軌道(FMO)計算プログラムABINIT-MPのGPU化等の高速化と共に、開殻・多参照系への対応を進めています。また、GPUを最初から意識したFMO-Xの新規開発も行っています。併せて、タンパク質の立体構造を予測するAlphaFoldのライブラリ整備もしています。
関連Webページ
報告書等 研究紹介ポスター / 最終報告書
業績一覧 (1) 学術論文 (査読あり)
[] Yoshitaka Moriwaki*, Taro Shiraishi, Yohei Katsuyama, Kenichi Matsuda, Jie Zhang, Toyoyuki Ose, Atsushi Minami, Hideaki Oikawa, Tomohisa Kuzuyama, Ryuichiro Ishitani, Tohru Terada, "High-throughput prediction of protein–protein interactions uncovers hidden molecular networks in biosynthetic gene clusters", Computational and Structural Biotechnology Journal, 35 (2026) csbj.0149.
(2) 国際会議プロシーディングス (査読あり)
該当なし
(3) 国際会議発表(査読なし)
該当なし
(4) 国内会議発表(査読なし)
[] "機械学習によるタンパク質内相互作用エネルギーの予測に関する最新動向"(口頭)土居英男*,芳根僚平, 高谷大輔,福澤薫,森義治,加藤幸一郎,田中成典,奥脇弘次,望月祐志, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/3.
[] "RI近似を用いたFMO法のGPUによる高速化"(口頭)中野達也*, 坂倉耕太, 成瀬彰, 片桐孝洋, 星野哲也, 大島聡史, 中島研吾, 石川岳志, 望月祐志, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/5.
[] "GPUアクセラレータ環境におけるMP2電子相関計算の性能最適化"(口頭)坂倉耕太*, 中野達也, 星野哲也, 大島聡史, 片桐孝洋, 望月祐志, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/5.
[] "「富岳」~「富岳NEXT」時代のフラグメント分子軌道(FMO)計算"(口頭)望月祐志*, 中野達也, 坂倉耕太, 土居英男, 芳根僚平, 奥脇弘次, 高谷大輔, 福澤薫, 加藤幸一郎, 田中成典, 星野哲也, 大島聡史, 中島研吾, 片桐貴洋, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/5.
[] "GPU時代に向けた量子化学プログラムABINIT-MPの性能最適化"(口頭:依頼)坂倉耕太, スーパーコンピュータ「不老・弐」へ向けたユーザ集会~AI for Scienceを支援するAI/エージェントスパコン稼働に向けて~, 名古屋, 2026/9/8.
[] "タンパク質-リガンド相互作用のテンソル分解によるデータ解析"(口頭)土居英男*, 奥谷星太郎, 小野寺光海, 新井大貴, 山本詠士, 平野秀典, 泰岡顕治, 田中成典, 福澤薫, 望月祐志, 応用物理学会秋期年会2026, 札幌, 2026/9/10.
[] "フラグメント分子軌道法に基づく機械学習ポテンシャルの構築とペプチド分子の分子動力学計算への応用"(口頭)森義治*, 加藤幸一郎, 量子生命科学会第8回大会, 宇治, 2026/5/27.
(5) 公開したライブラリなど
[] 「富岳」 Spack環境でのABINIT-MP Open Ver. 2 Rev. 12の公開(2026年8月)
(6) その他(特許,プレスリリース,著書等)
[] "フラグメント分子軌道法とは?", 望月祐志*, 田中成典, 福澤薫, 現代化学, 661(2026年4月号), 45-48.
[] "FMOプログラムと高速処理 - 超並列計算とGPUへの対応", 中野達也, 坂倉耕太, 望月祐志*, 現代化学, 662(2026年5月号), 51-54.
[] "FMO相互作用解析 - MD法と連携した動的解析", 田中成典*, 福澤薫, 望月祐志, 現代化学, 663(2026年6月号), 55-58.
[] HAIRDESC/RIST - 計算科学技術特論B (配信講義 2026/6/4&11) - ABINIT-MPプログラムによるフラグメント分子軌道(FMO)計算 1&2 - 望月祐志
[] Kiyoshi Tanaka, Takahiro Katagiri, Tatsuya Nakano, Yuji Mochizuki*, An Algorithm for computing Three- and Four-Body Density Matrices from CASCI Wavefunction and AI-Assisted Code Optimization
[] "感染症とFMO計算", 田中成典*, 福澤薫, 川下理日人, 望月祐志, 現代化学, 667(2026年10月号), 57-60.
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