採択課題 【詳細】
11-NA05 | 超並列分子軌道法プログラムOpenFMOの性能評価と高性能化 |
---|---|
課題代表者 | 南 一生(理化学研究所) |
概要 | 並列処理向きと考えられているフラグメント分子軌道(FMO)法を用いたハイスループットのタンパク電子状態計算を可能にすることを目指して、並列FMOプログラムOpenFMOの超並列化を行う。昨年度の負荷バランスに着目した最低化に引き続いて、今年度は、通信負荷に注目して、最適化を行うことにした。無駄な通信の削減や、通信と演算のオーバーラップなどを行うことで見かけの通信負荷を削減し、さらなる並列性能向上に挑む。 |
関連Webページ | |
報告書等 | 研究紹介ポスター / 最終報告書 |
業績一覧 | (1) 学術論文 (査読あり) |
該当なし | |
(2) 国際会議プロシーディングス (査読あり) | |
該当なし | |
(3) 国際会議発表(査読なし) | |
該当なし | |
(4) 国内会議発表(査読なし) | |
該当なし | |
(5) 公開したライブラリなど | |
該当なし | |
(6) その他(特許,プレスリリース,著書等) | |
該当なし |
無断転載禁止