採択課題 【詳細】
| 11-NA05 | 超並列分子軌道法プログラムOpenFMOの性能評価と高性能化 |
|---|---|
| 課題代表者 | 南 一生(理化学研究所) |
| 概要 | 並列処理向きと考えられているフラグメント分子軌道（FMO）法を用いたハイスループットのタンパク電子状態計算を可能にすることを目指して、並列FMOプログラムOpenFMOの超並列化を行う。昨年度の負荷バランスに着目した最低化に引き続いて、今年度は、通信負荷に注目して、最適化を行うことにした。無駄な通信の削減や、通信と演算のオーバーラップなどを行うことで見かけの通信負荷を削減し、さらなる並列性能向上に挑む。 |
| 報告書等 | 研究紹介ポスター ／ 最終報告書 |
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